"e-Pulse", energi yang dihasilkan dari pikiran dan emosi manusia, digunakan sebagai sumber daya untuk perangkat AI bernama "Sapotama". Namun dari balik perkembangan luar biasa ini, monster mengerikan mulai bermunculan—Digimon, makhluk hidup yang berevolusi dengan mengonsumsi e-Pulse.Tomoro Tenma terseret ke dalam pengalaman luar biasa setelah bertemu Gekkomon yang tiba-tiba muncul dari Sapotama-nya. Sambil tinggal bersama Kyo Sawashiro dan anggota tim pemburu hadiah "Golden Dawn", Tomoro memperbarui tekadnya. Masa depan baru seperti apa yang akan tercipta dari hubungan manusia dan Digimon?